D3-vitamin er et af de vitaminer, for hvilke en mangel kan forårsage alvorlige virkninger. Børn, der ikke får nok D3-vitamin i deres kostvaner, har øget risiko for at udvikle rakitis, en sygdom, der forårsager misdannelser i knogler og tænder hos børn.
Voksne med lave niveauer af D3-vitamin er mere tilbøjelige til at udvikle osteomalacia (svarer til rakitis) og lide af osteoporose, en knoglesvækkende sygdom. Det kan i vid udstrækning bruges i medicintilskud, ernæring, mad og fodertilsætningsstoffer osv.